Quantitative Proteomics

Label-Free Quantitation (LFQ)

MS1 Peak Intensity 기반 정량과 Spectral Counting 방식 비교 Proteomics LC-MS/MS 분석에서는 단백질의 존재 여부만 확인하는 것이 아니라, 샘플 간 단백질 abundance 차이를 비교하는 정량 분석이 매우 중요합니다. 예를 들어: 질병군 vs 정상군 약물 처리 전후 세포주 간 발현 차이 시간 경과에 따른 proteome 변화 등을 분석하기 위해서는 단백질 abundance를 정…

Willy's

DDA vs DIA Proteomics란 무엇인가?

LC-MS/MS 기반 단백체학에서 데이터 획득(Data Acquisition) 방식의 차이와 DIA Deconvolution의 핵심 원리 현대 LC-MS/MS 기반 proteomics에서는 수천~수만 개의 peptide를 동시에 분석해야 합니다. 하지만 질량분석기는 모든 precursor ion을 동시에 완벽하게 fragmentation할 수 없기 때문에, 어떤 precursor를 어떤 방식으로 선택하고 fragmentation할 것인지가…

Willy's
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