LC-MS 기본 & 원리

이온 모빌리티(Ion Mobility)란 무엇인가? LC-MS에 추가되는 새로운 분리 차원

액체크로마토그래피 질량분석법(LC-MS)은 복잡한 시료를 분석하는 데 매우 강력한 분석 기술입니다. LC에서는 화합물을 Retention Time 에 따라 분리하고, 질량분석기에서는 이온의 m/z(mass-to-charge ratio) 를 측정합니다. MS/MS를 사용하면 생성된 fragment ion을 분석하여 분자의 구조나 펩타이드 서열에 대한 추가적인 정보를 얻을 수 있습니다. 그런데 복잡한 시료를 분석하다 보면 한 가지 문제가 생깁니다…

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BSA는 정말 66.4 kDa일까? – 질량분석에서 숨겨진 동위원소 미세구조(Isotopic Fine Structure)의 세계

LC-MS를 공부하거나 프로테오믹스(Proteomics)를 접해본 사람이라면 BSA(Bovine Serum Albumin, Bovine Serum Albumin, 소 혈청 알부민) 라는 이름을 한 번쯤은 들어보셨을 것입니다. BSA는 생화학과 질량분석 분야에서 가장 널리 사용되는 표준 단백질 가운데 하나입니다. 단백질 정량 실험부터 효소 반응의 안정화, 질량분석기 성능 평가, LC-MS Calibration까지 다양한 용도로 사용되며, 연구…

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SMILES 기반 Structure-Aware Fragmentation을 이용한 LC-MS/MS 해석

현대 LC-MS/MS 분석은 단순히 precursor m/z 값을 측정하는 수준을 넘어, 분자의 구조(Structure)와 fragmentation chemistry를 함께 해석하는 방향으로 발전하고 있습니다. 특히 small molecule 분석에서는 단순 peak list 만으로는 다음과 같은 문제를 해결하기 어렵습니다. 왜 특정 fragment ion이 생성되는가? 어떤 결합이 preferentially cleavage 되는가…

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LC-MS/MS 실험실 환경 관리가 중요한 이유 — 온도, 습도, HVAC 문제가 장비 안정성과 수명에 미치는 영향

LC-MS/MS 시스템은 매우 민감한 고정밀 분석 장비입니다. 많은 사용자가: 질량 정확도(Mass Accuracy) 감도(Sensitivity)  [참고 :  Why LC-MS Sensitivity Gradually Decreases (감도 저하 원인) ] 분리능(Resolution) 크로마토그래피 조건 에 집중하지만, 실제 현장에서는 실험실 환경 조건 또한 장비 안정성과 수명에 매우 큰 영향을 줍니다. 실제로 많은 LC-MS 장애는 장비 …

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