LC-MS/MS 펩타이드 분석 오류 5가지 (Peptide Identification Pitfalls & 해결 방법) LC-MS/MS peptide identification 오류는 proteomics 분석에서 가장 흔한 실패 원인 중 하나입니다. LC-MS/MS를 이용한 Proteomics 분석은 단순한 질량 측정을 넘어, Fragmentation chemistry, Database search, Statistical validat…
LC-MS/MS 데이터 해석 가이드 (Fragmentation, Isotope, Contamination 총정리) LC-MS/MS 펩타이드 스펙트럼에서 b-ion fragment와 phosphorylation, acetylation, oxidation 등 PTM 피크를 표시한 분석 이미지 LC-MS/MS (Liquid Chromatography–Mass Spectrometry)는 proteomics 및 소분자 분석에서 가장 강력한 분석 기술…
NanoLC-ESI Emitters in Proteomics Pulled Glass, Metal-Coated, and Fused Silica Emitters nanoLC-ESI 시스템에서 emitter는 electrospray ionization의 안정성을 결정하는 핵심 부품 입니다. 특히 proteomics 분석에서는 femtomole 수준의 샘플을 분석하기 때문에 emitter 성능이 sensitivity와 reproducibilit…
Why NanoLC Signal Suddenly Becomes Unstable nanoLC-MS 분석에서 Signal이 갑자기 불안정해지는 이유 nanoLC-MS proteomics 분석에서는 매우 낮은 유량(flow rate)에서 LC separation과 electrospray ionization이 동시에 이루어집니다. 일반적인 nanoLC flow rate는 다음과 같습니다. 100 nL/min 200 nL/min 300 nL/m…
Column Bleed in LC-MS — Column에서 발생하는 Background Contamination 완전히 이해하기 LC-MS 분석을 수행하다 보면 sample과 무관한 background peak 가 나타나는 경우가 있습니다. 이러한 background signal의 중요한 원인 중 하나가 Column Bleed 입니다. Column bleed는 LC column의 stationary phase가 미량으로 용출되는 현상…