데이터 해석 & 팁

BSA는 정말 66.4 kDa일까? – 질량분석에서 숨겨진 동위원소 미세구조(Isotopic Fine Structure)의 세계

LC-MS를 공부하거나 프로테오믹스(Proteomics)를 접해본 사람이라면 BSA(Bovine Serum Albumin, Bovine Serum Albumin, 소 혈청 알부민) 라는 이름을 한 번쯤은 들어보셨을 것입니다. BSA는 생화학과 질량분석 분야에서 가장 널리 사용되는 표준 단백질 가운데 하나입니다. 단백질 정량 실험부터 효소 반응의 안정화, 질량분석기 성능 평가, LC-MS Calibration까지 다양한 용도로 사용되며, 연구…

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SMILES 기반 Structure-Aware Fragmentation을 이용한 LC-MS/MS 해석

현대 LC-MS/MS 분석은 단순히 precursor m/z 값을 측정하는 수준을 넘어, 분자의 구조(Structure)와 fragmentation chemistry를 함께 해석하는 방향으로 발전하고 있습니다. 특히 small molecule 분석에서는 단순 peak list 만으로는 다음과 같은 문제를 해결하기 어렵습니다. 왜 특정 fragment ion이 생성되는가? 어떤 결합이 preferentially cleavage 되는가…

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Top-down vs Bottom-up Proteomics

Sequence Coverage, Proteoform, ETD/ECD 그리고 Deconvolution의 진짜 의미 Proteomics(단백체학)에서 가장 널리 사용되는 분석 전략은 크게 두 가지입니다. Bottom-up Proteomics Top-down Proteomics 둘 다 LC-MS/MS 기반 기술이지만, 실제로는 “무엇을 관측하는가” 자체가 완전히 다릅니다. 특히 최근에는: Proteoform 분석 PTM conne…

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