현대 LC-MS/MS 분석은 단순히 precursor m/z 값을 측정하는 수준을 넘어, 분자의 구조(Structure)와 fragmentation chemistry를 함께 해석하는 방향으로 발전하고 있습니다. 특히 small molecule 분석에서는 단순 peak list 만으로는 다음과 같은 문제를 해결하기 어렵습니다. 왜 특정 fragment ion이 생성되는가? 어떤 결합이 preferentially cleavage 되는가…
현대 proteomics 분석에서 LC-MS/MS 시스템의 성능은 단순히 질량분석기 자체의 스펙만으로 결정되지 않습니다. 실제 peptide identification 품질은 다음과 같은 upstream 분석 조건에 훨씬 더 크게 영향을 받습니다. 샘플 준비(sample preparation) 오염(contamination) LC 분리 품질 ion suppression peptide cleanup gradient 최적…
Sequence Coverage, Proteoform, ETD/ECD 그리고 Deconvolution의 진짜 의미 Proteomics(단백체학)에서 가장 널리 사용되는 분석 전략은 크게 두 가지입니다. Bottom-up Proteomics Top-down Proteomics 둘 다 LC-MS/MS 기반 기술이지만, 실제로는 “무엇을 관측하는가” 자체가 완전히 다릅니다. 특히 최근에는: Proteoform 분석 PTM conne…