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Mascot 높은 점수의 함정: 왜 완벽해 보이는 MS/MS 스펙트럼이 틀린 매칭일까? (ft. CRAP Contamination)

Mascot에서 높은 점수인데도 틀린 경우 (MS/MS 해석 실전) MS/MS 스펙트럼은 좋아 보이는데 왜 잘못된 매칭이 나올까? + CRAP(cRAP: Common Repository of Adventitious Proteins) contamination까지 포함한 분석 1. 문제 상황 LC-MS/MS 분석에서 Mascot 검색 결과를 보면 높은 score를 가진 peptide가 나오는 경우가 많습니다. 하지만 실제로는 다음과 같은 문제가 …

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Mascot 검색 전에 반드시 해야 하는 MGF 데이터 QC

Mascot 검색 전에 반드시 해야 하는 MGF 데이터 QC 왜 필요한가 + 실전에서 확인해야 할 5가지 핵심 포인트 (상세 가이드) 1. 왜 MGF QC가 중요한가 (실무 관점) 실전 MGF 데이터 QC 구동 화면. Mascot 검색 전, 펩타이드 태그(Tag) 분석과 전하 상태(Charge) 일관성, 아미노산 조성 등을 미리 파악하여 데이터의 품질을 판단하고 불량 스펙트럼을 사전에 필터링합니다 (Willy's LCMS 프로그램 일부…

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