LC-MS/MS에서 SMILES란 무엇인가: 펩타이드 구조 해석과 활용 방법 LC-MS/MS 분석에서 SMILES는 무엇이며, 실제로 어떻게 사용될까요? SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System)는 분자의 구조를 텍스트로 표현하는 방식으로, LC-MS/MS에서 얻은 질량 데이터(m/z)와 화학 구조를 연결하는 데 사용됩니다. LC-MS/MS 기반 proteomics 분석은 질량 정보를 중심으…
LC-MS/MS 데이터 해석 가이드 (Fragmentation, Isotope, Contamination 총정리) LC-MS/MS 펩타이드 스펙트럼에서 b-ion fragment와 phosphorylation, acetylation, oxidation 등 PTM 피크를 표시한 분석 이미지 LC-MS/MS (Liquid Chromatography–Mass Spectrometry)는 proteomics 및 소분자 분석에서 가장 강력한 분석 기술…
Charge State Determination from Isotope Spacing (동위원소 간격으로 전하 상태를 결정하는 물리적 원리) LC-MS 스펙트럼 해석에서 가장 중요한 단계 중 하나는 이온의 전하 상태(charge state, z)를 결정하는 것입니다. 특히 ESI 기반 LC-MS/MS 분석 에서는 동일한 분자가 여러 개의 전하 상태로 관측되기 때문에, charge state를 정확히 파악해야 실제 분자량을 계산할 수 있습…
NanoLC-ESI Emitters in Proteomics Pulled Glass, Metal-Coated, and Fused Silica Emitters nanoLC-ESI 시스템에서 emitter는 electrospray ionization의 안정성을 결정하는 핵심 부품 입니다. 특히 proteomics 분석에서는 femtomole 수준의 샘플을 분석하기 때문에 emitter 성능이 sensitivity와 reproducibilit…