질량분석기 (LCMS, LC MSMS,Q-TOF, MALDI TOF..) : 동위원소
질량분석을 위한 사전 지식 - 동위원소 패턴 (Isotopic Pattern)
동위원소 패턴은 질량분석 데이터 해석에 있어 핵심적인 역할을 합니다. 특히 탄소의 M+1 피크와 황, 염소, 브롬과 같은 특정 원소들의 고유한 동위원소 분포는 분석자가 분자의 원소 조성을 신속하고 정확하게 판단하는 데 결정적인 정보를 제공합니다.
동위원소 패턴 (Isotopic Pattern) 이란?
동위원소 패턴은 질량분석 스펙트럼에서 관찰되는 독특한 피크 분포로, 시료를 구성하는 원소들의 자연계 존재 동위원소 비율 때문에 생겨납니다. 분자량(M)에 해당하는 주 피크(M+) 외에도, 더 무거운 동위원소를 포함한 분자들로 인해 M+1, M+2 등의 추가 피크들이 특정 상대 강도로 나타나는데, 이러한 전체적인 양상을 동위원소 패턴이라고 합니다. 이 패턴은 마치 분자의 고유한 지문 과도 같아서, 어떤 원소들이 얼마나 포함되어 있는지를 추론하는 데 결정적인 정보를 제공합니다.
원자의 기본 구성 요소
원자의 질량과 종류를 결정하는 데 중요한 역할을 하는 세 가지 핵심 구성 요소입니다.
- 질량수(Mass Number)
- 원자핵을 구성하는 양성자와 중성자의 총 개수를 의미합니다.
- 질량수 = 양성자 수 + 중성자 수
- 원자 번호(Atomic Number)
- 원자핵에 있는 양성자의 개수를 의미하며, 이는 특정 원소의 고유한 특성입니다.
- 양성자 수 = 원자 번호
탄소-12 (¹²C) 의 경우
원자 번호가 6이므로 양성자가 6개 있습니다.
질량수가 12이므로, 중성자는 (질량수 12 - 양성자 수 6) = 6개 있습니다.
특징: 자연계에 약 98.9%의 비율로 존재하며, 매우 안정적인 원소입니다. 모든 생명체의 기본 구성 원소이며, 질량의 기준으로도 사용됩니다.
특징: 자연계에 약 98.9%의 비율로 존재하며, 매우 안정적인 원소입니다. 모든 생명체의 기본 구성 원소이며, 질량의 기준으로도 사용됩니다.
탄소-13 (¹³C)
탄소의 또 다른 안정적인 동위 원소입니다.원자 번호가 6이므로 역시 양성자가 6개 있습니다.
질량수가 13이므로, 중성자는 (질량수 13 - 양성자 수 6) = 7개 있습니다.
원자 질량 단위(amu)의 기준: 탄소-12
¹²C : 12.0000 amu (원자 질량 단위)
국제 협약에 의해 질량이 정확히 12로 지정되었습니다.
원자 질량 단위 (amu): atomic mass unit. 1amu 는 탄소-12 원자 질량의 1/12
기본 개념: 동위원소와 자연 존재비
대부분의 원소는 핵 안에 중성자의 수가 다른 여러 종류의 동위원소를 가지고 있습니다. 이 동위원소들은 화학적 성질은 같지만 질량이 다릅니다. 자연계에 특정 비율로 존재하는데, 이를 '자연 존재비(Natural Abundance)'라고 합니다. 질량분석기는 분자를 이온화하여 질량 대 전하량(m/z) 비율에 따라 분리하고 검출하므로, 분자를 구성하는 원소의 동위원소 조합에 따라 다양한 질량의 이온들이 생성되고 각 질량에 해당하는 피크가 스펙트럼에 나타나게 됩니다.
주요 원소별 동위원소 패턴의 이해
1. 탄소 (Carbon, C): C12, C13
유기 화합물에서 가장 중요한 원소인 탄소는 동위원소 패턴을 이해하는 핵심입니다.
- Carbon-12 (C): 자연 존재비 약 98.9%
- Carbon-13 (C): 자연 존재비 약 1.1%
분자가 N개의 탄소 원자를 가지고 있다고 가정해 봅시다.
- M+ 피크: 모든 탄소가 C로만 이루어진 분자의 질량에 해당하는 피크입니다. 이 피크가 일반적으로 가장 강합니다.
- M+1 피크: 분자 내 탄소 원자 중 하나가 C로 대체되고 나머지는 C인 분자들의 합에 해당하는 피크입니다. 탄소 원자의 개수가 많을수록 M+1 피크의 상대 강도가 커집니다.
- 예시: 탄소 원자 1개()일 경우 M+1 피크 강도 약 1.1% (M+ 기준)
- 탄소 원자 10개()일 경우 M+1 피크 강도 약 10 x 1.1% = 11% (M+ 기준, 다른 원소 기여 무시 시)
- M+2 피크: 분자 내 탄소 원자 중 두 개가 C로 대체된 경우 등에 해당합니다. 이 피크는 상대적으로 약하지만, 탄소 수가 매우 많거나 다른 원소(예: 산소-18)의 기여가 있을 때 나타날 수 있습니다.
** 이 기여하는 M+1 피크의 상대적 높이**는 유기 분자의 탄소 원자 수를 추정하는 데 매우 유용하게 사용됩니다.
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| 탄소(C)의 동위원소 패턴 |
2. 수소 (Hydrogen, H)
- Hydrogen-1 (H): 자연 존재비 약 99.98%
- Deuterium (H, D): 자연 존재비 약 0.015% (매우 낮음)
- H의 자연 존재비가 워낙 낮기 때문에, 일반적인 질량분석에서는 수소에 의한 M+1 피크의 기여는 무시할 정도로 작습니다. 탄소-13에 의한 M+1 피크에 비해 훨씬 미미합니다.
3. 질소 (Nitrogen, N)
- Nitrogen-14 (N): 자연 존재비 약 99.63%
- Nitrogen-15 (N): 자연 존재비 약 0.37%
- 질소는 탄소에 비해 M+1 피크에 대한 기여가 작습니다. 그러나 질소의 존재는 질량분석 스펙트럼에서 홀수 분자량 규칙(Nitrogen Rule)과 관련하여 중요합니다 (질소 원자가 홀수 개 존재하면 분자량도 홀수, 짝수 개 존재하면 분자량도 짝수).
4. 산소 (Oxygen, O)
- Oxygen-16 (O): 자연 존재비 약 99.76%
- Oxygen-17 (O): 자연 존재비 약 0.04%
- Oxygen-18 (O): 자연 존재비 약 0.20%
- O가 대부분을 차지하며, O는 M+2 피크에 소량 기여할 수 있습니다. 일반적으로 산소의 동위원소 효과는 크지 않습니다.
5. 황 (Sulfur, S)
- Sulfur-32 (S): 자연 존재비 약 95.02%
- Sulfur-33 (S): 자연 존재비 약 0.75%
- Sulfur-34 (S): 자연 존재비 약 4.21%
- 황을 포함하는 분자는 뚜렷한 M+2 피크를 가집니다. S의 존재비가 상대적으로 높기 때문에, M+2 피크의 강도가 M+ 피크의 약 4% 수준으로 나타나, 황의 존재를 쉽게 알 수 있게 합니다.
6. 할로겐 (Halogens)
할로겐 원소는 매우 특징적인 동위원소 패턴을 보여주므로, 분자 내 할로겐의 존재를 확인하는 데 결정적인 단서가 됩니다.
염소 (Chlorine, Cl):
- Chlorine-35 (Cl): 자연 존재비 약 75.77%
- Chlorine-37 (Cl): 자연 존재비 약 24.23%
- 염소를 하나 포함하는 분자는 M+와 M+2 피크가 대략 3:1의 강도 비율로 나타납니다.
- 만약 염소 원자가 두 개 이상이라면, M+4, M+6 등의 피크도 나타나며, 그 패턴은 통계적인 조합에 따라 복잡해지지만 매우 독특하고 식별하기 쉽습니다. (예: 는 M+, M+2, M+4 피크가 ~9:6:1 비율로 나타남)
브롬 (Bromine, Br):
- Bromine-79 (Br): 자연 존재비 약 50.69%
- Bromine-81 (Br): 자연 존재비 약 49.31%
- 브롬을 하나 포함하는 분자는 M+와 M+2 피크가 거의 1:1의 강도 비율로 나타납니다.
- 두 개 이상의 브롬 원자를 가진 분자도 예측 가능한 특징적인 패턴을 보여줍니다. (예: 는 M+, M+2, M+4 피크가 ~1:2:1 비율로 나타남)
동위원소 패턴의 활용
분자식 추정: 질량분석을 통해 얻은 정확한 질량(정밀 질량) 정보와 동위원소 패턴은 미지의 화합물의 분자식을 추정하는 데 있어 매우 강력한 분석 도구로 작용합니다. 특정 동위원소 패턴은 해당 화합물 내 특정 원소의 존재를 강력하게 뒷받침합니다.
- 데이터 검증: 기존에 알려진 화합물의 경우, 이론적으로 계산된 동위원소 패턴과 실제 측정된 패턴을 서로 비교함으로써 분석 데이터의 신뢰성을 효과적으로 검증할 수 있습니다.
주요 원소별 동위원소 및 자연 존재비 표:
아래 표는 질량분석에서 중요하게 다루어지는 주요 원소들의 동위원소 및 그 자연 존재비입니다.
| 원소 (기호) | 동위원소 | 자연 존재비 (%) | 질량 (amu) | 비고 |
|---|---|---|---|---|
| 탄소 (C) | C | 98.9 | 12.0000 | 유기 분자 M+1 피크의 주 기여자 |
| C | 1.1 | 13.0034 | ||
| 수소 (H) | H | 99.98 | 1.0078 | |
| H | 0.015 | 2.0141 | (D, Deuterium) | |
| 질소 (N) | N | 99.63 | 14.0031 | |
| N | 0.37 | 15.0001 | ||
| 산소 (O) | O | 99.76 | 15.9949 | |
| O | 0.04 | 16.9991 | ||
| O | 0.20 | 17.9991 | ||
| 황 (S) | S | 95.02 | 31.9721 | M+2 피크의 뚜렷한 기여자 |
| S | 0.75 | 32.9715 | ||
| S | 4.21 | 33.9679 | ||
| 염소 (Cl) | Cl | 75.77 | 34.9689 | M+, M+2 피크 약 3:1 비율 |
| Cl | 24.23 | 36.9659 | ||
| 브롬 (Br) | Br | 50.69 | 78.9183 | M+, M+2 피크 약 1:1 비율 |
| Br | 49.31 | 80.9163 |
질량 단위
| 단위 (Unit) | 정의 (Definition) | 사용 맥락 (Usage Context) |
|---|---|---|
| g/mol (그램/몰) | 특정 물질 1몰(mole)의 질량을 그램(g)으로 나타낸 단위. 물질의 몰 질량을 의미합니다. | 주로 거시적인 양을 다루는 화학 양론 계산, 실험실에서 저울로 측정하는 물질의 질량 표현에 사용됩니다. |
| Da (달톤) | 탄소-12(¹²C) 원자 한 개의 질량의 정확히 1/12로 정의되는 단위입니다. 통합 원자 질량 단위(unified atomic mass unit)와 같습니다. | 개별 원자, 분자, 특히 단백질과 같은 생체 고분자(kDa)의 미시적 질량을 나타낼 때 사용됩니다. 질량분석법(MS)에서 m/z 값의 기본 단위입니다. |
| amu (원자 질량 단위) | Da와 정의 및 값이 정확히 같습니다. 탄소-12(¹²C) 원자 한 개의 질량의 정확히 1/12입니다. | 과거에 널리 사용되었던 명칭입니다. 현대에는 Da가 더 보편적이고 선호되는 단위입니다. |
질량분석기 종류와 변환 원리
질량분석을 위한 사전 지식
- 동위원소
- 이온화 방법들
- Liquid chromatography
질량분석기 구성요소들의 작동방식- Ion source
- Quadrupole
- Hexapole
- Collision Cell
- Pulsar
- Reflector
- Lens
- Detectors
- 기타 소모성 자재들 (Tubing, union, rotor seal, nut and ferrule..)
질량분석기 검출기 원리 및 스펙트럼 해석 기초
크로마토그래피와 질량분석의 연동 (GC-MS, LC-MS)
연동 분석의 필요성 및 장점
질량분석기(MS)의 주요 응용 분야
트러블 슈팅, 오염, 진공, 분리 주요원인과 대처방법
- Ion source
- Quadrupole
- Hexapole
- Collision Cell
- Pulsar
- Reflector
- Lens
- Detectors
- 기타 소모성 자재들 (Tubing, union, rotor seal, nut and ferrule..)
